Bioinżynieria (inżynieria bioprocesowa) – dział biotechnologii. Odpowiada na pytania z zakresu rozwiązywania technicznych i ekonomicznych problemów związanych z procesami biotechnologicznymi prowadzonymi w skali przemysłowej.
Główne obszary zainteresowań: optymalizacja procesów biochemicznych i mikrobiologicznych tworzenie nowych technologii projektowanie nowej aparatury (bioreaktory) projektowanie nowych urządzeń diagnostycznych i terapeutycznych
Gałęzią bioinżynierii jest biopreparacja (nauka o izolacji i oczyszczaniu produktów uzyskanych w procesach biochemicznych).