Curie za najlepszy doktorat w danym roku w danej dyscyplinie w Europie.
Tematyka jego dorobku obejmuje: metodologię procesu poznawczego, algorytmizację problemu odwrotnego, pomiary pośrednie źle uwarunkowane numerycznie, analizę spektralną i polaryzacyjną promieniowania rozproszonego w opisie właściwości układów dyspersyjnych, metodologię łączenia danych pomiarowych o różnej przestrzennej rozdzielczości z wykorzystaniem deterministycznych i stochastycznych metod przetwarzania, wykorzystanie reprezentacji czasowo-częstotliwościowych sygnałów w przetwarzaniu danych pomiarowych.
Jest twórcą opracowanej metody momentów w analizie układów dyspersyjnych.
Opracowane przez Janusza Mroczkę metody stanowią oryginalne narzędzie pozyskiwania, przetwarzania i modelowania sygnałów stąd stanowią podstawę konstrukcji aparatury pomiarowej.
Od 2020 roku jest na liście rankingu TOP 2% Scietists of the World.
Zestawienie dorobku Janusza Mroczki można znaleźć pod adresami https://orcid.org/0000-0001-8006-0246 i https://dona.pwr.edu.pl/szukaj/default.aspx?nrewid=138048.
Od 2008 redaktor serii monografii wydawanej pt. Problemy metrologii elektronicznej i fotonicznej.