Wolność wyznania Konstytucja zabrania dyskryminacji ze względu na religię oraz przewiduje wolność wyznania, religii i kultu. Mimo to w kraju od wielu lat trwają represje sił porządkowych wobec Kościoła katolickiego. Komisja Praw Człowieka (IACHR) w r. 2018 zgłosiła „poważne naruszenia praw człowieka w kontekście protestów społecznych w Nikaragui”. 13 lipca 2018 policja zabiła co najmniej dwóch studentów i raniła 10 innych w 15-godzinnym ataku na kościół rzymskokatolicki w Managui, który dawał schronienie dla protestujących studentów z pobliskiego kampusu uniwersyteckiego. Represje te znacznie się nasiliły w latach 20. XXI w.

Prześladowania Kościoła katolickiego Kościół katolicki w Nikaragui jest poddawany przeróżnym represjom. Stosunki między Kościołem katolickim a prezydentem Ortegą, które nigdy nie były bliskie, zostały definitywnie zerwane w lipcu 2018 r.Vatican News: Bp Silvio José Báez: „nie” dla zbrodniczych działań reżimu Ortegi. W roku 2022 Kościół w Nikaragui znalazł się wśród najbardziej prześladowanych wspólnot katolickich na świecieVatican News: Trwa prześladowanie Kościoła w Nikaragui.. Sandinistyczny lewicowy reżim Daniela Ortegi, rządzący w Nikaragui nieprzerwanie od 2007 roku, podejmuje działania wymierzone w biskupów, księży, katechetów, a także siostry zakonne.