W latach 20. XX wieku czasopismo straciło swoją pozycję na rzecz „Zeitschrift für Physik”. Wraz z falą emigracji w 1933 roku niemieckojęzyczne czasopisma straciły wielu swoich najlepszych autorów. Podczas II wojny światowej pismo nie ukazywało się, a wydawanie wznowiono w 1947 roku w radzieckiej strefie okupacyjnej. Po wznowieniu pismo nie mogło publikować artykułów z zakresu fizyki jądrowej, półprzewodników, technologii wysokiej częstotliwości i elektroniki.
W latach 60. XX wieku siedzibę redakcji „Zeitschrift für Physik” przeniesiono do Niemiec Zachodnich, a „Annalen der Physik” było wydawane w Lipsku przez fizyków z NRD.
W 1998 roku czasopismo zostało sprzedane Lisher Wiley-VCH. Czasopismo zaczęło być wydawane w formie elektronicznej, a jego archiwalne numery zostały zeskanowane i publicznie udostępnione w formie elektronicznej. W 2012 roku zaplanowano zmiany w sposobie wydawania czasopisma z jego nowym redaktorem i nową zawartością.