Loty kosmiczne Shenzhou 6 Start do misji Shenzhou 6 nastąpił 12 października 2005 z kosmodromu Jiuquan. Nie podczas misji był pilotem. Funkcję dowódcy pełnił natomiast Fei Junlong. Po blisko 10 minutach od startu pojazd kosmiczny wszedł na orbitę wokółziemską. Po wykonaniu manewru podniesienia orbity astronauci otworzyli właz przejściowy do modułu orbitalnego i dokonali jego inspekcji. Dopiero później obaj zdjęli skafandry. Podczas lotu obaj astronauci testowali wyposażenie swojego statku, prowadzili badania medyczne oraz szereg bliżej nieokreślonych eksperymentów.
Nie Haisheng obchodził na orbicie swoje urodziny, które według kalendarza księżycowego wypadały w tym roku w dniu 13 października.
16 października 2005 statek kosmiczny Shenzhou 6 pomyślnie wylądował w Chinach na terenie Mongolii Wewnętrznej.
Stowarzyszenie Uczestników Lotów Kosmicznych () przyznało mu Universal Astronaut Insignia za lot orbitalny (nr 439).
Wykaz lotów Loty kosmiczne, w których uczestniczył Nie Haisheng Nr Data startu Data lądowania Statek kosmiczny Funkcja Czas trwania 1 12 października 2005 16 października 2005 Shenzhou 6 Pilot 4 dni 19 godz. 32 min.