Do pomidora bakterie wnikają głównie przez uszkodzenia powstałe w trakcie zabiegów pielęgnacyjnych, podczas uszczykiwania pędów, przywiązywaniu pomidorów do sznurków czy podpór, albo podczas zbioru owoców. Może dojść do infekcji także przez korzenie, najczęściej podczas wysadzania rozsady. Doświadczalnie stwierdzono, że bakterie są zdolne infekować zdrowe i nieuszkodzone korzenie (np. podczas uprawy hydroponicznej). Bakterie rozprzestrzeniają się podczas nawadniania roślin, szczególnie gdy odbywa się to po zabiegach pielęgnacyjnych poprzez deszczowanie.
Ochrona Ponieważ Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis jest organizmem kwarantannowym, obowiązuje przestrzeganie zasad jego zwalczania ściśle uregulowanych przepisami fitosanitarnymi. Najważniejsze jest używanie do siewu zdrowych nasion. Aby pozbyć się z nich bakterii, są one poddawane dezynfekcji kwasem solnym podczas ich wydobywania z owoców. Zamiast kwasu solnego można też stosować termiczne odkażanie w wodzie o temperaturze 52 °C przez 20 min. Wszystkie używane do uprawy pomidorów skrzynki, doniczki, tyczki, oraz narzędzia powinny być pomiędzy kolejnymi uprawami zdezynfekowane albo termicznie, albo roztworem podchlorynu sodu.