Meczet został poważnie uszkodzony podczas trzęsień w latach 1648,1690 i 1714, wtedy to ucierpiały kopuły, a także w 1894 roku. W latach 1956-1957 meczet został odrestaurowany, jednak w 1999 podczas trzęsienia ziemi w Izmicie budowla ponownie została uszkodzona. Dziś stoi ona w dobrym stanie, lecz nadal zagrożona jest zniszczeniami, w związku z nawiedzającymi regularnie Turcję trzęsieniami ziemi.
Legenda Przez wieki w imperium krążyły pogłoski, jakoby Mimar Sinan był szaleńczo zakochany w sułtance Mihrimah, a obydwa meczety jej imienia zbudował bez wiedzy sułtana na dowód miłości, poświęcając własny majątek. Do dziś, uważa się, że jeden minaret przy meczecie Mihrimah przy Edirnekapı symbolizuje samotność Sinana, ponieważ jego uczucie było zakazane.
Owa legenda nadal żyje dzięki pewnemu detalowi. Mimar Sinan zbudował meczet przy Edirnekapı dokładnie w miejscu, w którym słońce zachodzi 21 marca, czyli w dniu urodzin Mihrimah. Zachód słońca, można oglądać za minaretem europejskiego meczetu, gdy księżyc wschodzi za minaretem po stronie azjatyckiej. Należy także dodać, że imię Mihrimah (osm. مهر ماه سلطان ) oznacza „słońce i księżyc” w języku perskim i sama sułtanka była nazywana "sułtanką słońca i księżyca".