Dekoracje Dekoracje w loggiach powstały w latach 1517–1519 (według innego źródła w latach 1518–1519). Na drugim piętrze powstał cykl 52 scen biblijnych, pochodzących wydarzenia z Księgi Rodzaju, z życia patriarchów, królów Izraela, proroków biblijnych, Marii z Nazaretu i Jezusa Chrystusa. Cykl, nazywany Biblią Rafaela, charakteryzuje się prostą, syntetyczną narracją. Freski zostały pomalowane na sklepieniu trzynastu przęseł krużganka. Według informacji podanych przez Giorgia Vasariego Rafaelowi pomagali: Giulio Romano, Giovanni da Udine, Perino del Vaga, , , Gianfrancesco Penni i Francesco Primaticcio zwany il Bologna. Przy malowaniu fresków pracował również .
Freski stanowią polemikę z scenami ukazany przez Michała Anioła na sklepieniu Kaplicy Sykstyńskiej. Historyk sztuki Luba Ristujczina porównując freski obu malarzy zwróciła uwagę, że Michał Anioł skupił się na eksponowaniu dramatyzmu, podczas gdy Rafael podjął się próby zjednoczenia kultury antycznej z chrześcijańską. Pierwotna struktura loggii była wzorowana na czwartym stylu pompejańskim.