Struktura organizacyjna Biuro Pełnomocnika Rządu do Spraw Osób Niepełnosprawnych składa się z komórek organizacyjnych o charakterze merytorycznym i pomocniczym. W jego strukturze wyodrębnia się pięć wydziałów oraz pięć zespołów, a także samodzielne stanowisko pracy.
Wydziały W skład Biura wchodzą następujące wydziały:
Wydział do Spraw Aktywizacji Zawodowej Wydział do Spraw Usług Wspierających i Włączenia Społecznego Wydział do Spraw Postępowań Administracyjnych Wydział do Spraw Nadzoru nad Ustalaniem Potrzeby Wsparcia i Świadczeniem Wspierającym Wydział do Spraw Organizacyjnych, Finansowych i Realizacji Projektów.
Zespoły W strukturze Biura funkcjonują również zespoły:
Zespół do Spraw Legislacji Zespół do Spraw Komunikacji Zespół do Spraw Badań i Współpracy Międzynarodowej Zespół do Spraw Sprawozdawczości i Kontroli Programów Finansowanych ze Środków Funduszu Solidarnościowego Zespół do Spraw Nadzoru nad Orzekaniem o Niepełnosprawności.
Inne komórki W Biurze funkcjonuje także:
Samodzielne Stanowisko Pracy do Spraw Obsługi Prawnej sekretariat
Zadania pełnomocnika Pełnomocnik Rządu do Spraw Osób Niepełnosprawnych, przy wsparciu Biura: