W 1661 roku, w okresie ponownej katolicyzacji za panowania Ferdynanda Marii Bawarskiego, w klasztorze zamieszkało czterech mnichów z . Oficjalna reaktywacja placówki nastąpiła 29 lipca 1669. W 1684 roku opactwo przyłączono do , a rok później rozpoczęto budowę nowych zabudowań klasztornych. W latach 1690–1695 wzniesiono nowy kościół klasztorny pw. św. Jana Ewangelisty, a w 1700 roku ukończono budowę czteroskrzydłowego kompleksu. Przy budowie pracowali tacy artyści jak: , Christoph Grantauer, Anton Denzler czy bracia Cosmas i Egid Asamowie. W 1717 roku do Michelfeldu przeniesiono siedzibę benedyktyńskiego seminarium.

Klasztor został zlikwidowany 23 kwietnia 1803, w okresie sekularyzacji. Kompleks klasztorny mieścił urząd skarbowy, dom leśniczego i plebanię, a kościół opacki przekształcono w kościół parafialny. Zabudowania gospodarcze zlicytowano, a zbiory biblioteki przeniesiono w 1835 roku do Ambergu. 29 października 1884 obiekt zakupił Johann Evangelist Wagner, rektor seminarium w Dillingen an der Donau, który otworzył tu dom opieki prowadzony przez siostry franciszkanki. W 1951 roku na wieży kościoła zawieszono dzwon, odlany przez ludwisarnię z Münsteru, który dołączył do dwóch mniejszych, gotyckich dzwonów.