FC Barcelona Atlètic 19 czerwca 2023 r., po rozegraniu czternastu meczów i strzeleniu jednej bramki, Faye dołączył do FC Barcelona Atlètic, drużyny rezerw FC Barcelony. Faye podpisał czteroletni kontrakt w Barcelonie i dołączył do drużyny rezerw. Został powołany do pierwszej drużyny, ale nie został piłkarzem pierwszego zespołu.
Stade Rennais FC 25 sierpnia 2024 roku Faye opuścił FC Barcelonę i dołączył do Stade Rennais FC, podpisując czteroletni kontrakt, obowiązujący do czerwca 2028 roku. Wartość transferu szacowana jest na 10,3 mln euro, z klauzulą wykupu w wysokości 25 mln euro na rzecz Dumy Katalonii. 27 września zadebiutował w Ligue 1 w przegranym spotkaniu 3:1 przeciwko Paris Saint-Germain.
W swoim pierwszym sezonie w czerwono-czarnej koszulce Mikayil Faye odniósł mieszane wrażenia. Sprowadzony jako potencjalny gracz podstawowego składu, szybko znalazł się na ławce rezerwowych, gromadząc niewiele minut na boisku pomimo kilku występów w pierwszym składzie pod wodzą Jorge Sampaoli.