W 1873 w Waplewie Wielkim zbudowano kaplicę grobową, gdzie spoczęły ciała rodziny Sierakowskich (obecnie jest to kościół). Znajduje się w niej wiele cennych zabytków, m.in. późnogotycka rzeźba Madonny z Dzieciątkiem z ok. 1516 pochodząca pierwotnie z Bazyliki Mariackiej w GdańskuPiotr Skurzyński: Warmia, Mazury, Suwalszczyzna, Wyd. Sport i Turystyka – Muza S.A., Warszawa 2004, s. 32, , alabastrowy relief Zmartwychwstanie Chrystusa z Mechelen (XVI/XVII wiek, obecnie eksponowany w Sali Gdańskiej pałacu), barokowy ołtarz, figura św. Kazimierza z XVIII wieku oraz liczne epitafia Sierakowskich.
Na przełomie XIX i XX wieku zarządcą majątku był hrabia Adam Sierakowski. Do waplewskiego majątku należały folwarki Rychendrysy (obecnie Andrzejewo należące do Moran), Tillendorf, Olszak i Waplewko. W samym Waplewie znajdowały się wówczas szkoła katolicka, szpital i gorzelnia parowa.
Ostatnim właścicielem majątku był Stanisław Sierakowski (m.in. prezes Związku Polaków w Niemczech w latach 1922–1933 i poseł na sejm pruski w okresie 1921–1928), brutalnie zamordowany w październiku 1939 przez Niemców po tygodniu tortur wraz z żoną Heleną, córką Teresą i jej mężem Tadeuszem Gniazdowskim.
Od 1933 majątkiem, z wyłączeniem pałacu i parku, władał Zbigniew Donimirski.