Formuła 1 Słabe występy w F3000 odebrały mu jednak możliwość startów jako kierowca w zespole. Jednak w tym momencie swoją pomoc zaoferowała firma Red Bull i to dzięki jej funduszom Bernoldi zadebiutował w Formule 1. W 2001 roku Enrique zadebiutował w zespole Arrows, jednakże słaby bolid nie pozwalał mu na rozwinięcie skrzydeł. Podczas GP Monako Brazylijczyk przez 35 okrążeń skutecznie bronił się przed o wiele szybszym od niego Davidem Coulthardem w McLarenie. Sezon skończył bez jakiejkolwiek zdobyczy punktowej, lecz trzykrotnie udało mu się znaleźć w pierwszej 10 wyścigu, z najlepszym miejscem dotychczas w karierze (8 miejsce w GP Niemiec).

Rok 2002 także spędza w Arrowsie, lecz zespół zbankrutował, a kierowca przeniósł się do World Series by Nissan. Podczas dwóch sezonów startów uzyskał dobre rezultaty (w 2003 – był szósty, rok później już trzeci). Dzięki wsparciu firmy BAT dostał propozycję testów dla zespołu BAR-Honda. W latach 2004–2006 Enrique Bernoldi jest drugim oficjalnym kierowcą testowym zespołu. W sezonie 2007 ścigał się natomiast w Stock Car Brasil, brazylijskich wyścigach samochodów podobnych do NASCAR.