Jako czołowy tenisista z Indii występował jako singlista w reprezentacji w Pucharze Davisa. W reprezentacji narodowej był jednak przede wszystkim deblistą, szczególnie skutecznym w parze z Leanderem Paesem. Do największych osiągnięć Hindusa w reprezentacji należy awans z zespołem do ćwierćfinału grupy światowej z edycji z roku 1996. W 1998 roku jego zespół spadł do niższej klasy rozgrywek, Azja/Oceania. Do czołowego grona drużyn Indie wraz z Bhupathim powróciły w roku 2010.
Mahesh Bhupathi pięciokrotnie reprezentował Indie na igrzyskach olimpijskich. Podczas turnieju gry podwójnej w Atenach (2004) awansował z Leanderem Paesem do strefy medalowej. Półfinałowy mecz z niemiecką parą Nicolas Kiefer–Rainer Schüttler Hindusi przegrali 0:2. Ostatecznie zajęli czwarte miejsce, pojedynek o brąz przegrywając 1:2 z Chorwatami Mariem Ančiciem i Ivanem Ljubičiciem.
Finały w turniejach ATP World Tour Gra mieszana (8–4)
Gra podwójna (52–44)