W 2003 był w gronie założycieli Fundacji Nadzieja, w której objął funkcję przewodniczącego Rady Fundatorów. Otrzymał godność archidiakona Kapituły Metropolitalnej Warszawskiej. Gdy w 2012 spowodował kolizję drogową, prowadząc samochód w stanie nietrzeźwości, zaprzestał wykonywania obowiązków biskupich, a po tym, jak w 2013 sąd pierwszej instancji za ten czyn skazał go na karę 6 miesięcy pozbawienia wolności z warunkowym zawieszeniem jej wykonania na dwuletni okres próby, a także orzekł wobec niego m.in. grzywnę i czteroletni zakaz prowadzenia pojazdów, pozostawał do 2015 zawieszony przez Stolicę Apostolską w pełnieniu funkcji biskupich.
W ramach Konferencji Episkopatu Polski w latach 1996–2003 był krajowym asystentem kościelnym Akcji Katolickiej w Polsce, w latach 2004–2012 pełnił funkcję przewodniczącego Zespołu ds. Unii Europejskiej i reprezentował Konferencję w Komisji Konferencji Biskupów Wspólnoty Europejskiej, gdzie w latach 2006–2012 zajmował stanowisko wiceprzewodniczącego, objął ponadto funkcje przewodniczącego Rady ds. Społecznych i wiceprzewodniczącego Komisji „Iustitia et Pax”, a także wszedł w skład Komisji Rewizyjnej, Rady ds. Środków Społecznego Przekazu i Zespołu ds. Akcji Katolickiej. W 1998 został członkiem Papieskiej Rady Iustitia et Pax.