Plewka górna o długości mniej więcej równej długości plewki dolnej. Pylniki o długości 1–2 mm są zamknięte (klejstogamia). Roślina samopylna. Owoc Dość gruby ziarniak, o podwiniętych brzegach z rowkami na grzbietowej stronie.
Biologia i ekologia Jest chwastem segetalnym rosnącym w uprawach pszenicy i żyta na wilgotnych glebach. Poza tym występuje na przydrożach i ugorach. Kwitnie od czerwca do lipca. W klasyfikacji zbiorowisk roślinnych gatunek charakterystyczny dla O. Centauretalia cyanii, Ass. Vicietum tetraspermae, Ass. Consolido-Brometum. Liczba chromosomów 2n = 28Bromus secalinus na Flora of China [dostęp 2014-01-28]..
Zagrożenia Gatunek umieszczony był na Czerwonej liście roślin i grzybów Polski z 2006 roku pośród gatunków narażonych na wyginięcie (kategoria zagrożenia V). Na liście z 2016 roku takson nie został uznany za zagrożony.
Znaczenie i zastosowanie Jest chwastem zbóż znanym już z okresu neolitu. Miejscami stokłosa ta była też uprawiana jako zboże. Przed rozpowszechnieniem się metod chemicznego zwalczania chwastów w zbożach nasiona stokłosy żytniej miały dość znaczny udział w plonach i spożywane były razem ze