Takie zalecenie podyktowane jest częstymi problemami z systemem operacyjnym Microsoft Windows przy przełączaniu trybu pracy AHCI już po zainstalowaniu systemu.
Tryb PATA zapewnia wsteczną kompatybilność dla kontrolerów SATA w systemach operacyjnych, które nie obsługują standardu SATA (np. Windows 95, Windows 98, Windows Me) lub systemach, które wymagają dodatkowych sterowników (Windows 2000, Windows XP)
Systemy operacyjne a współpraca z AHCI Microsoft Windows: Windows Vista, Windows 7, Windows 8, Windows 10 – pełne wsparcie wcześniejsze wersje Windows wymagają oddzielnych sterowników lub nie obsługują AHCI Linux (począwszy od kernela w wersji 2.6.19.) – pełne wsparcie NetBSD (niektóre wersje) – wsparcie w trybie AHCI bez potrzeby instalacji dodatkowych sterowników OpenBSD (od wersji 4.1) – obsługuje sterownik AHCI FreeBSD – wspiera AHCI Mac OS X (Intel) – wymagane AHCI Solaris 10 – wsparcie dla AHCI zaimplementowane w wydaniu 8/07
Starsze systemy operacyjne do obsługi AHCI wymagają sterowników napisanych pod określone urządzenie.