Od drugiej edycji o klubowym mistrzostwie Europy decydował dwumecz. Pierwszym mistrzem w tej formule została szwedzka Umeå IK, która powtórzyła to osiągnięcie w kolejnym sezonie. W kolejnych dwóch edycjach zwyciężyły zespoły z Niemiec. Najpierw pierwszy tytuł w historii zdobył zespół 1. FFC Turbine Potsdam, a następnie zespół z Frankfurtu została pierwszym zespołem, który dwukrotnie sięgnął po tytuł mistrzowski. W sezonie 2006/2007 po raz pierwszy i jak dotąd jedyny zwycięzcom Ligi Mistrzów została angielska drużyna. Tytuł zdobyła londyńska drużyna Arsenal. W sezonie 2007/2008 po raz trzeci w historii mistrzowski tytuł zdobyła drużyna z Frankfurtu. Do tej pory żaden zespół nie zdobył tyle razy tego trofeum. Rok później do grona zwycięzców rozgrywek z Niemiec dołączyła drużyna FCR 2001 Duisburg. Zespół ten pokonał w dwumeczu rosyjską Zwiezdę-2005 Perm zwyciężając w pierwszym spotkaniu 6:0. Wynik ten jest rekordowym zwycięstwem w finałowym spotkaniu tych rozgrywek.