Osoby chorujący na zespół Wiskotta-Aldricha wykazują zwiększoną skłonność do zachorowań na nowotwory złośliwe, takie jak np. białaczkę i chłoniaki oraz choroby autoimmunologiczne.
Badania dodatkowe trombocytopenia poniżej 100 000 niskie stężenie immunoglobuliny M niskie stężenie izohemaglutynin prawidłowe stężenia IgG i prawidłowe lub podwyższone IgE i IgA biopsja szpiku celem wykluczenia innych schorzeń przebiegających z zaburzeniami odporności (sam zespół Wiskotta-Aldricha nie powoduje charakterystycznych zaburzeń szpiku kostnego)
Stopnie zaawansowania Jin i współpracownicy w 2004 zaproponowali następującą klasyfikację ciężkości choroby: 0,5 trombocytopenia nawracająca 1,0 trombocytopenia i małe płytki 2,0 trombocytopenia, leczący się wyprysk skóry, sporadyczne infekcje dróg oddechowych 3,0 wyprysk skórny i infekcje dróg oddechowych wymagające stosowania antybiotyków 4,0 wyprysk skórny wymagający stałego leczenia lub zagrażające życiu infekcje 5,0 choroba autoimmunologiczna lub nowotworowa