Pod koniec sezonu do Autobotów dołącza Smokescreen, a trójka "tajemniczych Miniconów" łączy się w trakcie finałowej bitwy w Star Saber - miecz o ogromnej mocy, którego posiadaczem staje się Hot Shot. Sezon 2 Początek sezonu jest bardzo burzliwy. Na początku sezonu do obu frakcji dołączają Sideways i Scavenger, którzy szybko jednak zmieniają strony. Deceptikony dzięki Sidewaysowi szybko przejmują Star Saber. Tymczasem Megatron dzięki Scavengerowi dowiaduje się o Skyboom Shield - tarczy równie silnej jak Star Saber i tworzonej przez trzy Minicony. Deceptikonom udaje się szybko je złapać i w samą porę do Autobotów dołącza Blurr. Megatron postanawia zniszczyć Autoboty dzięki dwóm superbroniom. Optimus pod koniec starcia przejmuje Skyboom Shield, dzięki której Autoboty wygrywają potyczkę. Wojna schodzi na tory wojny pozycyjnej i wiele się nie zmienia do czasu przybycia taktyka Thrusta, który zastawił na Autoboty pułapkę, która się nie udała jedynie z powodu Jetfire'a. Druga zasadzka, była też przemyślana, ale się nie udała tym razem przez Optimusa. Prime w trakcie bitwy połączył się z Jetfirem w Jet Convoya i pokonał większość Deceptikonów, które przez to musiały się wycofać. Sezon 3 Deceptikony są rozgoryczone ostatnimi porażkami Thrusta, który "nie umie wygrać nawet jednej bitwy". Sideways zdradza Deceptikony i opuszcza je.