Ich dziećmi są: arcyksiążę Johannes Austriacki (ur. 1997), arcyksiążę Ludwig Austriacki (ur. 1998), arcyksiężniczka Isabel Austriacka (ur. 2000), arcyksiężniczka Carlota Austriacka (ur. 2003), arcyksiążę Philipp Austriacki (ur. 2007), księcia Pedro Burbon-Sycylijskiego, księcia Noto (ur. 1968, w Madrycie), od 2001 męża Sofii Landaluce y Melgarejo (ur. 1973), wnuczki księcia San Fernando de Quiroga. Ich małżeństwo początkowo uznawane było za morganatyczne, jednak ostatecznie uznano je za dynastyczne, a dzieci księcia Pedro dziedziczą rodzinne tytuły i mają prawo do tronu sycylijskiego: książę Jaime de Borbón-dos Sicilias y Landaluce, książę Capui (ur. 1992), książę Juan de Borbón-dos Sicilias y Landaluce (ur. 2003), książę Pablo de Borbón-dos Sicilias y Landaluce (ur. 2004), książę Pedro de Borbón-dos Sicilias y Landaluce (ur. 2007), księżniczka Sofia de Borbón-dos Sicilias y Landaluce (ur. 2008), księżniczka Blanca de Borbón-dos Sicilias y Landaluce (ur. 2011), księżniczkę Inés María Burbon-Sycylijską (ur. 1971, w Madrycie), od 2001 żonę neapolitańskiego arystokraty – Nobile Michele Carrelli Palombi dei Marchesi di Raiano (ur. 1965). Ich dziećmi są: Nobile Teresa Carrelli Palombi dei Marchesi di Raiano (ur. 2003), Nobile Blanca Carrelli Palombi dei Marchesi di Raiano (ur.