od tej pory uchodzi za standardowe dzieło na temat teorii i historii psychoanalizy.
W 1964 roku odwrócił się od Lacana i wraz z innymi założył Association Psychanalytique de France. W tym samym roku został członkiem komitetu redakcyjnego Les Temps Modernes i rozpoczął wykłady w École pratique des hautes études. W 1970 powołał do życia czasopismo Nouvelle Revue de Psychanalyse – był jego wydawcą do 1994 roku. W skład komitetu redakcyjnego wchodzili, m.in. Didier Anzieu, André Green, Guy Rosolato i Jean Starobinski. W 1979 roku zaczął brać udział w pracach kolegium lektorskiego Éditions Gallimard – rok później zaczął publikować własne prace literackie.
Publikacje W Polsce Jean-Bertrand Pontalis znany jest wyłącznie jako współautor (razem z Jeanem Laplanche) Słownika psychoanalizy, Wydawnictwa Szkolne i Pedagogiczne, .
L'Enfance d'un autre, 1952 Après Freud, Gallimard-Tel, Paris, 1965 Entre le rêve et la douleur, éd.