Kapitan Weddigen poległ 18 marca 1915 na U-29 150px|right Utworzona 27 września 1935 w Kilonii, przeniesiona w czerwcu 1941 do Brestu, zlikwidowana w 1944.
Należało do niej 111 okrętów typu: IIB (14)W nawiasach podana jest liczba jednostek danego typu w tej flotylli., IIC (8), IID (13); po 1941 dołączyły okręty typu: VIIB (3), VIIC (81), VIIC/41 (2), XB (2).
Dowódcy flotylli: Kpt. zur SeePodany stopień podczas sprawowania funkcji. Karl Dönitz (wrzesień 1935 – grudzień 1935)Tu w nawiasach podany okres sprawowania funkcji. Kpt. zur See Otto Loycke (styczeń 1936 – wrzesień 1937) Kptlt. Hans-Günther Looft (październik 1937 – wrzesień 1939) Korvkpt. Hans Eckermann (wrzesień 1939 – październik 1940) Korvkpt. Hans Cohausz (listopad 1940 – luty 1942) Kptlt. Heinz Buchholz (luty 1942 – lipiec 1942) Korvkpt. Werner Winter (lipiec 1942 – wrzesień 1944)
Dowódcy okrętówWymieniono dowódców, którzy odznaczyli się wyjątkową skutecznością w walce.: Korvkpt. Adalbert Schnee Kptlt. Rolf Mützelburg Kptlt. Friedrich Guggenberger