Projekt zagospodarowania terenu przygotowanego przez ówczesnego proboszcza parafii Św. Stanisława - ks. Leonarda Karolewskiego, przewidywał budowę kościoła, plebanii i domu katechetycznego, którego parter stał się tymczasową kaplicą, a piętro - mieszkaniem dla księży. Architekturę nowej świątyni opracował mgr inż. Jerzy Kociołowicz, projekt konstrukcyjny wykonał inż. Tomasz Kowalewski. W dniu 27 lipca 1986 r. nowo powstała parafia otrzymała zezwolenie na budowę świątyni, a już 12 sierpnia 1986 roku rozpoczęto wykopy pod fundamenty kościoła. Kamień węgielny – pochodzący z krypty kościoła Narodzenia NMP w Jerozolimie – wmurował dnia 18 września 1988 r. ks. bp Henryk Muszyński. Pierwszą w historii parafii wizytację kanoniczną przeprowadził w dniach 3–4 czerwca 1989 r. ks. bp Czesław Lewandowski – ówczesny sufragan włocławski. W dniu 20 października 1993 roku oddano do użytku boczną nawę kościoła, która przez sześć lat służyła jako kaplica.
25 marca 2001 r. miała miejsce konsekracja kościoła nowej świątyni pod przewodnictwem Ordynariusza diecezji ks. bpa Bronisława Dembowskiego. Koncelebrantami byli ks. bp Stanisław Gębicki i ks. bp Czesław Lewandowski.