Rodzi w marcu bądź kwietniu. Na świat wydaje od jednego do 4 szczeniąt, starsze dane podawały nawet do sześciu. Nie widzą, ale mają już futro. Masa ciała w pierwszym dniu życia wynosiła 40–44,5 g. Pomiary trzeciego dnia życia wynosiły 108–115 mm długości głowy i ciała, 45–46 mm długości ogona. Ssą one mleko matki od 61 do 70 dni. Po 3 tygodniach zaczynają konsumpcję mięsa. Złapane wcześniej łatwo oswajają się. Po 11–12 dniach podwajają swoją masę. Początkowo przebywają w wygrzebanej w piasku norze, a niekiedy wśród roślin takich jak Calligonum comosum czy Aristida pungens. Obserwowano wielkie, przypominające labirynt jamy w bardziej trwałych glebach. Niekiedy jest aż 15 wyjść, a nora obejmuje aż 120 m². Tak skomplikowanych nor nie daje się budować w miękkim, zapadającym się piasku – tam nory są małe i proste, z jednym wejściem i pojedynczym tunelem wiodącym do komory, gdzie znajdują się młode. W siódmym tygodniu życia zaczynają niezdarne polowania. Osobniki z poprzednich roczników mogą zostawać z rodzicami po narodzeniu się kolejnego miotu. Do rozrodu fenek pustynny przystępuje po raz pierwszy w wieku między 9 miesiącami a jednym rokiem.