Pod koniec XIX wieku majątek Łyntupy stanowiły wioski Szudowce, Kaznodzieiszki, Pozhliki, Peszkowce i zaścianki Stukowszczyzna, Jawneliszki, Venter, Bałduk, Sienkiszki, Trabuciszki, Ignaciszki (wszystkie z nich należały do społeczności wiejskiej Łyntupy). Przez miasteczko przechodziła linia kolei wąskotorowej Nowe Święciany – Głębokie.
W 1904 roku pracę rozpoczęła destylarnia. W 1908 na miejscu starego, drewnianego kościoła zbudowano murowany. W 1909 w Łyntupach otwarto szkołę publiczną. Podczas I wojny światowej w 1915 przez miasto przechodziła linia frontu.
W 1905 roku wymieniono miasteczko Łyntupy, dwór i osadę kolejową. Miasteczko liczyło 646 mieszkańców, 419 dziesięcin; dwór liczył 95 mieszkańców, 7408 dziesięcin, był własnością Byszewskiego; osada kolejowa liczyła 24 mieszkańcówГошкевич И. И. Виленская губернія: Полный списокъ населенныхъ мѣстъ со статистическими данными о каждомъ поселеніи, составленный по оффиціальнымъ свѣдѣниямъ, Вильна, 1905, s. 293. mały|Łyntupy w 1916 r.