W latach 1993–1999 pełnił funkcję dziekana Wydziału Nauk Historycznych UMK, a od 1999 do 2002 był prorektorem uczelni. W 2008 przeszedł na emeryturę. Wykładał potem jeszcze przez kilka lat (do 2018) w Katedrze Socjologii w Wyższej Szkole Informatyki i Ekonomii TWP w Olsztynie.
Zasiada w komisji rewizyjnej Towarzystwa Naukowego w ToruniuInformacje na stronie TNT. Jest członkiem krajowym korespondentem Wydziału Historyczno-Filozoficznego Polskiej Akademii Umiejętności (od 1996), członkiem czynnym PAU (od 20 czerwca 2009), a także członkiem Towarzystwa Naukowego im. Wojciecha Kętrzyńskiego.
Odznaczenia i nagrody Odznaczony Złotym Krzyżem Zasługi. W 2004 otrzymał Medal Komisji Edukacji Narodowej, Medal „Za zasługi położone dla rozwoju Uczelni” przyznany przez Senat UMK, a także Krzyż Kawalerski Orderu Odrodzenia Polski. W 2007 otrzymał nagrodę im. ks. Leopolda Otto. 17 września 2009 odebrał tytuł doktora honoris causa na Uniwersytecie Warmińsko-Mazurskim w Olsztynie.
Życie prywatne Syn Karola Małłka. Żonaty z dr Ewą Małłek z domu Tybor (ur. 1943), ma córkę dr Małgorzatę Małłek-Grabowską (ur. 1980).