Wszyscy dawniej biorący udział nadawcy skandynawscy podjęli decyzję o wycofaniu się, ponieważ konkurs wywierał zbyt dużą presję na uczestniczące dzieci, oraz zdecydowali się przywrócić regionalny konkurs dla dzieci o nazwie MGP Nordic. Mimo tego, Szwecja wzięła udział, ponieważ obowiązki zostały przejęte przez prywatnego nadawcę TV4. Wycofał się również frankofoński nadawca RTBF z Belgii który był współorganizatorem rok wcześniej, a od tego czasu jedynym nadawcą konkursu w kraju był flamandzkojęzyczny VRT.
Finał +Uczestnicy Konkursu Piosenki Eurowizji Junior 2006 L.p. Kraj Wykonawca PiosenkaJęzyk Miejsce Punkty1Pedro Madeira„Deixa-me sentirportugalski14222Luis Panagiotu i Christina Christofi„Agoria koritsia” grecki8583Kimberly„Goed”niderlandzki12444New Star Music„Povestea mea”rumuński6805Nazar Slusarczuk„Chłopczyk rock 'n' roll” ukraiński9586Dani„Te doy mi voz”hiszpański4907Neustrašivi Učitelji Stranih Jezika„Učimo strane jezike”serbski5818Sophie Debattista„Extra Cute”angielski11489Zana Aliu„Vljubena” macedoński151410Molly Sandén „Det finaste någon kan få”szwedzki311611Chloi Sofia Boleti„Den pirazi” grecki133512Andrej Kuniec„Nowyj dień” białoruski212913Thor!„Een tocht door het donker”niderlandzki77114Mateo Đido„Lea”chorwacki105015Siostry Tołmaczowe„Wiesiennij dżaz” rosyjski1154