Początki założenia klubu Sydney FC zostały podjęte w kwietniu 2004 roku przez federacje stanową Soccer New South Wales (obecna nazwa Football NSW), która ogłosiła zamiar ubiegania się o licencję dla klubu w rozgrywkach A-League. W czerwcu 2004 roku do Football Federation Australia (FFA) wpłynęło 20 wniosków o przyznanie licencji na grę w A-League. Dwie spośród złożonych ofert pochodziło z Sydney. Druga konkurencyjna oferta pod nazwą "Sydney Blues" została złożona przez konsorcjum pod przewodnictwem Nicka Politisa. Pomiędzy obiema ofertami wybuchła publiczna awantura, kiedy FFA zapowiedziało poparcie oferty klubu Sydney FC. Przyczyniło się to do wycofania oferty złożonej przez Nicka Politisa. Przez okres czterech kolejnych miesięcy każdy z otrzymanych wniosków licencyjnych był analizowany. Ostatecznie, 1 listopada 2004 roku, pozytywnie rozpatrzono osiem ofert, wpośród których została zaakceptowana oferta klubu Sydney FC. Jednocześnie zgodnie z polityką FFA („jeden klubu z jednego miasta”) klub Sydney FC otrzymał wyłączną licencję na występowanie w rozgrywkach A-Legue na okres 5 lat od sezonu 2005/2006. W tym czasie inny zespół z Sydney nie mógł dołączyć do rozgrywek A-League.