Po pierwszym powrocie do Japonii został mianowany profesorem anatomii w nowo utworzonej Szkole Medycznej Niigata. Po drugim powrocie z Zurychu mianowany na profesora anatomii, histologii i embriologii na Wydziale Medycznym Cesarskiego Uniwersytetu Tohoku w Sendai, piastował tę funkcję do 1941 roku Tohoku University Medical Library . W latach 1925–1927 był dziekanem Uniwersytetu.
Jego uczniami byli Kodama, Seto, Yamazaki, Ogawa, Yamada, Katsumata, Suzuki, Fukuyama i Ikeda.
W 1921 roku zdobył prestiżową Nagrodę Japońskiej Akademii (jap. 恩賜賞). W 1946 roku otrzymał nominację na członka Akademii.
W 1929 roku w Monachium uczył się neuropatologii u Walthera Spielmeyera.
Zmarł 12 grudnia 1946 w SendaiTeizo Ogawa: Nachruf auf Gennosuke Fuse. Mit 1 Bildnis. Anatomische Nachrichten 1, s. 270, 1949Tomoyuki Ogawa. GENNOSUKE FUSE - A Great Master of Anatomy, Omnividens No. 22, pp. 6-8, 2007 PDF.