Wtedy też została nadana nazwa Uniwersytet Waseda, pochodząca od nazwy miejscowości Waseda, stanowiącej obecnie część dzielnicy Shinjuku w Tokio.
Uniwersytet początkowo składał się z wydziałów: nauk politycznych, prawa, języka angielskiego oraz nauk fizycznych (zamknięty w trzecim roku funkcjonowania z braku aplikacji) oraz kolejno: literatury (1890 r.), edukacji (1903), handlu (1904), nauk ścisłych i inżynierii (1909) i inne w następnych latach.
Uniwersytet został zniszczony podczas II wojny światowej i odbudowany w 1949 r.
Symbole Godłem uczelni są stylizowane znaki w starej pisowni: 大學, znaczące „uniwersytet”, umieszczone na tle kłosów ryżu.
Hymn uczelni Miyako no seihoku (Northwest of the Capital) został skomponowany w 1907 roku przez wykładowcę Tetteki Tōgi na 25. rocznicę jej istnienia. Słowa napisał na zlecenie uniwersytetu poeta Gyofū Sōma (1883–1950).
Sztandar uczelni, wprowadzony w 30. roku jej funkcjonowania, ma kolor bordowy. Na tym tle umieszczone jest złote godło uczelni.
W 2000 r. na zjeździe absolwentów zaprezentowano nową, oficjalną maskotkę uniwersytetu – niedźwiedzia zw.