1 stycznia 2007 roku zostało przekształcone z zakładu budżetowego w jednostkę budżetową.
Działalność Krajowe Centrum Hodowli Zwierząt wykonuje następujące zadania: 1) kontrolę: a) w zakresie prowadzenia oceny wartości użytkowej i hodowlanej oraz hodowli zwierząt i rozrodu, b) zootechniczną w handlu, c) sposobu wykorzystania środków pochodzących z dotacji budżetowych przyznanych podmiotom realizującym zadania w zakresie postępu biologicznego w produkcji zwierzęcej; 2) prowadzenie: a) laboratorium badania grup krwi, b) laboratorium referencyjnego badającego mleko w ramach oceny wartości użytkowej bydła, owiec i kóz; 3) współpracę z organizacjami międzynarodowymi działającymi w dziedzinie hodowli, oceny i rozrodu zwierząt gospodarskich.