kancelaria; referat organizacyjny; komisja gospodarcza; oddział sztabowy; warsztat mechaniczny; magazyn materiałowy.
2. Wydział I Triangulacyjny.
referat trygonometryczny; referat niwelacyjny; referat fotogrametryczny.
3. Wydział II Topograficzny.
referat topograficzny; referat konstrukcyjny; referat sprawdzania map;
4. Wydział III Kartograficzny.
referat kartograficzny; referat reprodukcyjny; referat redakcyjny; biblioteka i archiwum;
5. Skład map.
Przy Wojskowym Instytucie Geograficznym zorganizowana była Oficerska Szkoła Topografów, podlegająca szefowi Wydziału II Topograficznego, oraz Szkoła Kreślarzy, podlegająca szefowi Wydziału III Kartograficznego.
Oficerska Szkoła Topografów przy Wydziale II Topograficznym Wojskowego Instytutu Geograficznego kształciła zawodowych oficerów geografów. Szkoliła również na specjalnych kursach (w zakresie topografii), oficerów poszczególnych broni, a zwłaszcza artylerii, lotnictwa i marynarki.