28 grudnia 1902 erygowano samodzielną parafię pw. św. Mikołaja, a od 12 marca 1903 ks. Maksymilian Wontropka został jej pierwszym proboszczem. W nowej parafii powołano wiele stowarzyszeń katolickich: Katolicki Związek Młodzieży i Mężczyzn, Katolickie Stowarzyszenie Kobiet, Stowarzyszenie Muzyczne „Cecilia” oraz Katolickie Posłannictwo Kolejarskie. Początkowo parafią zarządzał sam proboszcz, a od 1928 przydzielono parafii również wikariusza. Podczas oblężenia Kędzierzyna przez wojska radzieckie, w czasie drugiej wojny światowej proboszcz (od 1937 Georg Wotzka) musiał opuścić parafię, przenosząc się do Sławięcic, gdzie w 1949 zmarł. W 1946 parafia została przejęta przez księży ze Zgromadzenia Misjonarzy Oblatów Maryi Niepokalanej. Następnie po utworzeniu w 1982 nowej, sąsiedniej parafii św. Eugeniusza de Mazenod w dzielnicy Pogorzelec i przeniesieniu się tam księży oblatów, parafię od 1984 ponownie objęli księża diecezjalni.