Newcastle Jets zainaugurowało rozgrywki w A-League w dniu 26 sierpnia 2005 roku w domowym spotkaniu przeciwko Adelaide United FC. Spotkanie zakończyło się porażką gospodarzy w stosunku 0:1. W sezonie 2005/2006 klub Newcastle Jets zakończył sezon zasadniczy na 4. miejscu z dorobkiem 31 punktów i awansował do serii finałowej rozgrywek. Klub w serii finałowej zakończył zmagania na etapie ćwierćfinału, w którym w dwumeczu uległ drużynie Central Coast Mariners FC (wynik w dwumeczu 1:2).
W trakcie sezonu 2006/2007 stanowisko trenera zostało objęte przez Australijczyka Gary’ego van Egmonda, który poprowadził klub do 3. miejsca w sezonie zasadniczym oraz do półfinału serii finałowej. W serii finałowej Newcastle Jets przegrało po konkursie rzutów karnych z drużyną Adelaide United (w meczu 1:1, w rzutach karnych 3:4). W następnym sezonie 2007/2008 klub wywalczył 2. miejsce w sezonie zasadniczym z dorobkiem 34 punktów. Natomiast w finale rozgrywek (tzw. Grand Final) Newcastle Jets pokonało zespół Central Coast Mariners w stosunku 1:0 i zdobyło pierwszy tytuł mistrzowski w swojej historii. Gary van Egmond prowadził Newcastle Jets do końca sezonu 2008/2009, w którym to klub zajął ostatnie 8. miejsce w sezonie zasadniczym zdobywając 18 punktów.