W 1994 roku wysłano na Maltę 4 kolejnych misjonarzy Szkoły Gilead. W roku 1994 Międzynarodowe Stowarzyszenie Badaczy Pisma Świętego (IBSA) stało się niezarejestrowanym stowarzyszeniem na Malcie reprezentującym Świadków Jehowy. 16 kwietnia 1997 roku IBSA zostało zarejestrowane. W 1998 roku otwarto nowy dom misjonarski, biuro tłumaczeń i Salę Królestwa w miejscowości Mosta. W 2008 roku wydano Pismo Święte w Przekładzie Nowego Świata w języku maltańskim. Chrześcijańskie Pisma Greckie (Nowy Testament) w tym języku wydano w 2004 roku.
Od 16 do 18 października 2015 roku w Mediterranean Conference Centre w Valletcie odbył się kongres specjalny pod hasłem „Naśladujmy Jezusa!” z udziałem Świadków Jehowy z Malty oraz ponad 1550 zagranicznych delegatów z Australii, Grecji, Hiszpanii, Izraela, Portugalii i Stanów Zjednoczonych.
W lipcu 2016 roku delegacja Świadków Jehowy z Malty uczestniczyła w kongresie specjalnym pod hasłem „Lojalnie trwajmy przy Jehowie!” w Paryżu.
28 grudnia 2021 roku zarejestrowano osobę prawną „Świadkowie Jehowy na Malcie”. Chociaż uznanie prawne IBSA w roku 1997 dało zborom pewien zakres praw, jednak były one ograniczone.