Po rozpadzie ZSRR przedsiębiorstwo znalazło się na niepodległej Ukrainie, nosząc nazwę Kompania Lotnicza Motor Sicz. Zostało następnie przekształcone w spółkę akcyjną. Od 1988 roku dyrektorem, a od 1991 roku dyrektorem generalnym był Wiaczesław Bogusłajew, który kierował nim przed dwie pierwsze dekady XXI wieku. Bogusłajew, uważany za ukraińskiego oligarchę, stał się również bezpośrednim właścicielem 15% akcji spółki, pośrednio kontrolując ją także przez inne podmioty. Przedsiębiorstwo było jednym z największych producentów silników lotniczych na świecie, eksportując wyroby do ponad 120 krajów. W okresie maksymalnego rozwoju produkowała 55 modeli silników.
Obecnie jest jedną z wiodących światowych korporacji w zakresie rozwoju, produkcji, naprawy i serwisu lotniczych turbinowych silników spalinowych do samolotów i śmigłowców, a także przemysłowych instalacji turbin gazowych. W 2017 roku firma zatrudniała 27 320 pracowników.
Istotnym rynkiem pozostawała Rosja, która na początku XXI wieku kupowała ponad 80% silników dla produkowanych śmigłowców w Motor Siczy, co stanowiło prawie połowę produkcji zakładów. Kooperacja z Rosją została utrudniona po aneksji Krymu w 2014 roku, co było jednym z powodów pogorszenia sytuacji przedsiębiorstwa.