W 1582 ogłosił w Niemczech Aigentliche Beschreibung der Raiß inn die Morgenländerin, dziennik z podróży (ukazał się także w języku polskim i holenderskim). Dziennik pisał z punktu widzenia protestanckiego pielgrzyma. Jego spostrzeżenia z Jerozolimy i życia mnichów na Bliskim Wschodzie, zarówno chrześcijańskich jak i muzułmańskich, są szczególnie wartościowe dla historii.
W 1588 powrócił do katolicyzmu i stał się liderem augsburskiej opozycji protestanckiej.
W 1596 wstąpił do wojska cesarskiego walcząc z Turkami na Węgrzech, gdzie zmarł.
Odniesienia do dzieł Leonharda Rauwolfa Karl H. Dannenfeldt, Leonard Rauwolf, sixteenth-century physician, botanist, and traveller. Cambridge (Mass) 1968. Ray, John. Ray, John. FRS.Collection of Curious Travels & Voyages in two tomes the first containing Dr. Leonhart Rauwolff's Itinerary into the eastern countries ..., the second taking in many parts of Greece, Asia Minor, Egypt, Arabia Felix and Patraea, Ethiopia, the Red-Sea. Published in 1693. Marseille 1900 s. 9-11. Franz Babinger, "Leonhard Rauwolf, ein Augsburger Botaniker und Ostenreisender des sechzehnten Jahrhunderts," Archiv für die Geschichte der Naturwissenschaften und der Technik, 4 (1913), 148-61.