Z końcem 1938 roku Jarosłavia uniezależniła się od TG „Sokół”, przyjmując nazwę Jarosławski Klub Sportowy, w skrócie JKS Jarosław.
Na Zielone Świątki tj. dni 25/26 maja 1947 zaplanowano uroczyste otwarcie stadionu przy ul. Bandurskiego.
We wczesnym okresie PRL drużyny JKS występowały pod innymi nazwami w ramach nomenklatury zrzeszeń sportowych: Związkowiec Jarosław (1949–1950), Spójnia Jarosław (1951–1954), Sparta Jarosław (1955).
17 grudnia 1988 odbyła się w Jarosławiu uroczystość z okazji 50-lecia istnienia JKS. W 1989 zorganizowano plebiscyt na najpopularniejszego sportowca 50-lecia klubu, w którym pierwsze miejsce zajęła Maria Kiper-Oczakowska (piłka ręczna), drugie Bronisław Dudziński (podnoszenie ciężarów, hokej na lodzie), trzecie Adam Kisiel i Ryszard Blajer (kajakarstwo), zaś działaczem 50-lecia został wybrany Roman Bester.
W 1999 na 90. rocznicę istnienia, dla podkreślenia długiej historii klubu do nazwy dodano rok powstania klubu- JKS 1909 Jarosław.
W sezonie 2009/2010 zajął 11. miejsce w IV lidze podkarpackiej. W sezonie 2010/2011 uplasował się na 4. miejscu tracąc szansę na awans w ostatniej kolejce. W sezonie 2013/2014 będąc beniaminkiem III ligi zespół w rundzie jesiennej był liderem, a ostatecznie rozgrywki zakończył na 2. miejscu.