Drugi tor przy peronie 2 to tor nr 1. Obecna budowla peronowa pochodzi z lat 50 lub 60 ubiegłego wieku. Wejście na peron wyspowy jest możliwe z kładki dla pieszych, która rozciągnięta jest nad torami stacji. Kładka umożliwia również przejście z ulicy Okrzei na Zakolejową, między którymi usytuowana jest stacja. Na stacji funkcjonuje przejście dla pieszych w poziomie torów, które umożliwia przejście z peronu 1 na peron 2. Głównym elementem stacji jest zabytkowy budynek dworcowy. Obok dworca kolejowego znajduje się autobusowy zespół przystankowy (odjeżdżają z niego zarówno autobusy miejskie, jak i komunikacja prywatna) oraz tzw. park kolejowy. W przeszłości istniał także budynek dworca PKS.
Kierowaniem ruchem pociągów na stacji Wyszków zajmują się dwie nastawnie: dysponująca Wz oraz podlegająca jej wykonawcza Wz1. Obecnie na stacji kolejowej Wyszków zatrzymują się wyłącznie pociągi Kolei Mazowieckich. Bezpośrednio ze stacji Wyszków możemy dojechać pociągiem głównie do Tłuszcza oraz Ostrołęki. W mniejszej ilości kursują tu także bezpośrednie składy do Warszawy czy Łowicza. Wjeżdżają tu także obecnie pojedyncze pociągi z Żyrardowa, Grodziska Mazowieckiego czy Sochaczewa.