W 2018 objął stanowisko profesora uczelni w Akademii Sztuk Pięknych w Warszawie. Pracował jako kurator programu dyskursywnego i badań Biennale Warszawa (2018–2019). Prowadził badania lub był profesorem wizytującym na Uniwersytecie w São Paulo, w (Akademie der Künste der Welt) w Kolonii i w Instytucie Nauk o Człowieku w Wiedniu.
Działalność kulturalna i społeczna W 1999 był współtwórcą Wydawnictwa Ha!art, następnie redaktorem jego Linii Radykalnej oraz działu kulturoznawczego magazynu „Ha!art” (1999–2008), a także wiceprezesem (2004–2009) i przewodniczącym rady Fundacji Korporacja Ha!art (2009–2014).
Należał do pierwszych osób spoza środowiska informatycznego, które zajmowały się w Polsce licencjami otwartymi. W 2003 w magazynie Ha!art ukazał się przetłumaczony przez niego tekst Open Source – wielka promocja rozdawania, gdzie m.in. pojawia się jedna z pierwszych w polskiej prasie informacji o Wikipedii, która miała wtedy 20 tys. haseł (patrz link na końcu artykułu). Zarówno książki autorstwa Jana Sowy, jak i redagowane przez niego w wydawnictwie Korporacja Ha!art ukazywały się na otwartych licencjach.