Występował w brytyjskich serialach telewizyjnych, w tym NCS: Manhunt (2002), Szpital Holby City (2002), Prawa Murphy’ego (2005) z Jamesem Nesbittem, Klątwa upadłych aniołów (2004−2005) i Poirot (2006). Pojawił się w teledysku zespołu Cooper Temple Clause do piosenki „Blind Pilots” (2003). W filmowej adaptacji komiksu Franka Millera 300 (2006) w reż. Zacka Snydera został obsadzony w roli spartańskiego wojownika Steliosa. W dramacie Steve’a McQueena Głód (2008) zagrał irlandzkiego republikanina, lidera IRA Bobby’ego Sandsa.
Ma własną firmę produkcyjną o nazwie Peanut Productions. W 2009 otrzymał dwie statuetki Irlandzkiej Nagrody Filmowej i Telewizyjnej (IFTA) oraz British Independent Film Award. Na 68. MFF w Wenecji otrzymał Puchar Volpiego dla najlepszego aktora za rolę w filmie Wstyd (2011).
Był na okładkach magazynów takich jak „Elle”, „L’Uomo Vogue”, „Rolling Stone”, „Esquire”, „Details”, „The Hollywood Reporter”, „GQ”, „People”, „Interview”, „Vanity Fair” i „Entertainment Weekly”.
Kariera wyścigowa Od 2020 Fassbender występuje w European Le Mans Series, a w 2022 jechał w 24h Le Mans. Spróbował także sił w Porsche Supercup.
Życie prywatne W październiku 2017 na Ibizie poślubił aktorkę Alicię Vikander;