W niejasnych okolicznościach pobił i zabrał broń niemieckiemu oficerowi, po czym uciekł do lasu, gdzie się ukrywał.
Lis dołączył się do działającego w okolicy oddziału partyzanckiego złożonego z Polaków i zbiegłych jeńców radzieckich, który nie podlegał bezpośrednio żadnej strukturze politycznej. W wyniku podziału objął dowództwo nad jego częścią, która podporządkowała się Narodowej Organizacji Wojskowej. Pod koniec 1942 podporządkował się Narodowym Siłom Zbrojnym, objął dowództwo nad oddziałem Akcji Specjalnej NSZ. Jego oddział atakował mniejsze ugrupowania Wehrmachtu, niszczył niemiecką infrastrukturę na poligonie, zastraszał niemieckich osadników oraz volksdeutschów. W odwecie Niemcy 2 kwietnia 1943 spalili gospodarstwo jego rodziców i zabili ojca i siostrę. W odpowiedzi oddział Lisa, który przyjął wówczas pseudonim „Mściciel”, zintensyfikował swoją działalność, m.in. 18 września 1943 zlikwidował Otto Engelhardta, dowódcę niemieckiej żandarmerii na terenie Lager Mielec.