Struktura Gabinet Polityczny Ministra Biuro Administracyjne Biuro Dyrektora Generalnego Biuro Ministra Biuro Zarządzania Zasobami Ludzkimi Departament Ekonomiczno-Finansowy Departament Informacji, Promocji i Szkoleń Departament Instytucji Certyfikującej Departament Koordynacji i Wdrażania Programów Regionalnych Departament Koordynacji Polityki Strukturalnej Departament Koordynacji Programów Infrastrukturalnych Departament Koordynacji Wdrażania Funduszy Unii Europejskich Departament Prawny Departament Programów Pomocowych i Pomocy Technicznej Departament Programów Ponadregionalnych Departament Przygotowania Projektów Indywidualnych Departament Unii Europejskiej i Współpracy Międzynarodowej Departament Współpracy Terytorialnej Departament Zarządzania Europejskim Funduszem Społecznym Departament Zarządzania Programami Konkurencyjności i Innowacyjności Stanowisko do Spraw Audytu Wewnętrznego Stanowisko do Spraw Komunikacji Społecznej i Mediów Stanowisko do Spraw Obronnych Stanowisko do Spraw Ochrony Informacji Niejawnych
Jednostki podległe Ministerstwu Rozwoju Regionalnego: Centrum Projektów Europejskich
Minister rozwoju regionalnego i budownictwa Jerzy Kropiwnicki (ZChN) od 16 czerwca 2000 do 19 października 2001