Po oddaniu mostu do użytku w 1970 roku, torowisko tramwajowe było usytuowane niesymetrycznie, po wschodniej stronie mostu.
W 1994 roku zespół z Politechniki Wrocławskiej opracował ekspertyzę, z której wynikała konieczność pilnego remontu przeprawy. W kolejnych latach umocniono skarpy nasypu ziemnego, na którym spoczywała jezdnia, a w 2004 roku rozpoczęto remont kapitalny przy udziale środków z Unii Europejskiej. Przebudowę mostu wykonano na podstawie projektu Biura Projektów Budownictwa Komunalnego w Bydgoszczy autorstwa mgr inż. Jana Siudy. Most wzmocniono do nośności 40 ton, zaś torowisko tramwajowe przeniesiono na środek pomiędzy jezdnie. Wzmocnienia dokonano poprzez przyklejenie taśm z włókien węglowych oraz przezbrojenie płyty pomostu z użyciem lekkiego kruszywa. Wykonawcą był poznański oddział firmy Mitex.
W 2023, w związku z zarysowaniem jednej z pięciu belek nośnych, wprowadzono zakaz wjazdu na most pojazdów o masie większej niż 10 t (z wyjątkiem autobusów i tramwajów) oraz wyższych niż 3,8 tMost Pomorski w Bydgoszczy nie dla ciężarówek. Objazd Trasą Uniwersytecką. oraz obniżono dopuszczalną prędkość pozostałych samochodów i autobusów do 30 km/h, a tramwajów do 10 km/h.