Debiutował dnia 27 lutego w meczu z byłym klubem Oldham Athletic, zachowując czyste konto jego zespół wygrał 1:0.
W kwietniu Rachubka doznał kontuzji, przez co musiał pauzować sześć tygodni. Wznowił treningi trzynastego maja na pierwszy półfinałowy mecz z Oldham Athletic w rundzie play-off trzeciej ligi angielskiej. Zespół z nadmorskiego kurortu wygrała oba mecze, Rachubka zagrał 27 maja w finale, który odbył się na nowo wyremontowanym stadionie Wembley. Blackpool wygrało 2:0 z Yeovil Town, uzyskując awans do Championship, drugiej ligi angielskiej.
Blackpool 5 czerwca 2007 roku, 5 dni po wygaśnięciu kontraktu z Huddersfield, Rachubka podpisał dwuletni kontrakt na stałe z klubem Blackpool FC z siedzibą przy Bloomfield Road.
W dniu 13 sierpnia 2007 roku zespół został nagrodzony mianem „Team Of The Week” w Championship za wspaniały mecz tuż przed otwarciem nowego sezonu 2007/08, Rachubka i koledzy pokonali zespół Leicester City, 1:0 na wyjeździe. Rachubka był podstawowym bramkarzem w sezonie 2007/08.