Anderson ma także dwóch braci przyrodnich, Leopolda Stanislausa „Stana” Stokowskiego (ur. 1950) oraz Christophera Stokowskiego (ur. 1952), z wcześniejszego małżeństwa matki z Leopoldem Stokowskim, dyrygentem polskiego pochodzenia"Living with Loss" Kim Hubbard, People.
Gdy był dzieckiem, jego zdjęcia (autorstwa Diane Arbus) ukazały się w magazynie „Harper’s Bazaar”. W wieku trzech lat gościł z matką w jednym z wydań programu The Tonight ShowThe New York Times, 17 września 1970, str. 95.. Przez trzy lata, w wieku 10-13 lat był modelem Ford Models i brał udział w pokazach Ralpha Laurena, Calvina Kleina oraz Macy’s.
Podczas drugiego semestru nauki w Dalton School, w wieku 17 lat, wyjechał do Afryki Południowej. Zachorował tam na malarię i był hospitalizowany w kenijskim szpitalu. W 1985 ukończył Dalton School i kontynuował swoją edukację na Uniwersytecie Yale, gdzie studiował politologię i stosunki międzynarodowe. Podczas nauki w college’u spędził dwa okresy letnie pracując w Centralna Agencja Wywiadowcza. Mimo że nie posiadał formalnego wykształcenia dziennikarskiego, wolał poświęcić się karierze w mediach, niż pozostać w agencji po ukończeniu szkołyAnderson Cooper's CIA secretSo what do you do, Anderson Cooper?. Po pierwszych doświadczeniach korespondencyjnych na początku lat 90.