Pozostałą część Polaków wykazujących sympatie wobec okupantów oraz Kaszubów, Mazurów i Ślązaków, pogardliwie określonych jako Wasserpolen, szacował na około 1,2 mln i przeznaczał do „całkowitego zniemczenia”. Memoriał wyszczególniał także 530 000 Żydów mających zostać wysiedlonych wraz z Polakami. Zdecydowanie polska ludność – o ile nie nadaje się do zasymilowania – powinna zostać wysiedlona, a pozostała zniemczonaTraktowanie ludności byłych obszarów Polski z punktu widzenia polityki rasowej, Urząd Polityki Rasowej, Berlin 1939..
W latach 1941–1944 był referentem do spraw rasowych (Rassereferent) utworzonego w lipcu 1941 Ministerstwa Rzeszy dla Okupowanych Terenów Wschodnich (Reichsministerium für die besetzten Ostgebiete, RMfdbO) zwanego w skrócie Ostministerium. Był także autorem komentarza do słynnego planu germanizacji podbitych ziem na wschodzie oraz zagłady Żydów i Słowian – Generalplan Ost. Wetzel analizował ten plan w swoim komentarzu z 27 maja 1942 pt. (Ocena i uwagi do generalnego planu wschodniego Reichsfūhrera SS), stając się jego współautorem. Postulował w nim, w celu szybkiej germanizacji wschodu, przesiedlenie około 50 milionów mieszkańców wschodniej Europy, zaczynając od 20 milionów Polaków, jako najbardziej niebezpiecznych dla III Rzeszy. Rekomendował przesiedlenie Polaków z terenów Polski do Brazylii.