Geologia thumb|Trzy główne strefy: thumb|Wodospady na Renie (Rheinfall) w pobliżu Schaffhausen – największe wodospady w Europie thumb|Wzgórza na południe od Berna thumb|Finsteraarhorn – najwyższy szczyt kantonu Berno thumb|Alpy Berneńskie w okolicach Grindelwald thumb|Creux du Van w kantonie Neuchatel thumb|Rzeka Doubs thumb|Dolina Lauterbrunnen thumb|Koziorożec w dolinie Lötschental
Największy wpływ na obecne ukształtowanie terenu Szwajcarii miała orogeneza alpejska, podczas której powstały Alpy.
Krystaliczne podłoże uformowało się w paleozoiku, od 540 do 360 mln lat temu. Następnie między 205 a 96 mln lat temu uformował się między Eurazją a Afryką Ocean Tetydy. Ocean ten osiągnął swą maksymalną wielkość w kredzie, 135 mln lat temu. Kolizja między płytą eurazjatycką a afrykańską spowodowała stopniowe zanikanie tego oceanu. Proces kolizji tych płyt trwa do dziś. Wynikiem tego właśnie procesu jest wypiętrzenie się Alp. Wyżyna Szwajcarska zbudowana jest głównie z molasy, skały osadowej powstałej na dnie starego oceanu.
Szwajcaria leży w regionie dość spokojnym pod względem tektonicznym, chociaż w 1356 doszło tu do trzęsienia ziemi, na skutek którego całkowicie została zniszczona Bazylea. Było to największe zjawisko sejsmiczne w historii całej Europy Środkowej.