Premierowe gole w najwyższej klasie rozgrywkowej strzelił 14 listopada 2007 w wygranej 2:0 konfrontacji z Pachucą.
W wiosennym sezonie Clausura 2008 Domínguez zdobył z Cruz Azul tytuł wicemistrza kraju, mając pewne miejsce w linii defensywy. Sukces ten powtórzył również pół roku później, podczas jesiennych rozgrywek Apertura 2008, zaś po raz trzeci wicemistrzostwo zanotował w sezonie Apertura 2009. W tym samym roku dotarł również ze swoim zespołem do finału najbardziej prestiżowych rozgrywek północnoamerykańskiego kontynentu – Ligi Mistrzów CONCACAF. W 2010 roku powtórzył to osiągnięcie, natomiast w sezonie Clausura 2013 wywalczył swoje czwarte wicemistrzostwo kraju, a także triumfował w rozgrywkach pucharu Meksyku – Copa MX. W 2014, współtworząc parę stoperów z Luisem Amaranto Pereą, po raz pierwszy w karierze wygrał natomiast północnoamerykańską Ligę Mistrzów, a kilka miesięcy później wziął udział w Klubowych Mistrzostwach Świata, gdzie zajął z Cruz Azul czwarte miejsce.